Главная
   Монографии
    -  Интеллектуальный Анализ
        Данных в финансах

    -  Компьютерное познание
   Главы в монографиях
   Реляционный анализ данных
    -  Существо подхода
    -  Теория и методы
     - Сравнение
      с другими методами

   Компьютерное познание
    -  Проблема предсказания
    -  Теория измерений
    -  Вероятностные формальные
      понятия

    -  Проблема индукции
    -  Классификация как закон
   Моделирование когнитивных
   процессов

    -  Принципы
    -  Теория функциональных
      систем

    -  Моделирование аниматов
    -  Восприятие
   Приложения
    -  Финансовый прогноз
    -  Биоинформатика
    -  Медицина
    -  Анализ жульничества
    -  Другие приложения
   Проекты
   Лекции и учебное пособие
   Авторы и контакты
    -  Евгений Витяев
    -  Борис Ковалерчук


Рейтинг@Mail.ru

Last updated 10/02/2016

Приложения в биоинформатике

  • Y.Y. Vaskin, I.V. Khomicheva, E.V. Ignatieva, E.E. Vityaev ExpertDiscovery and UGENE integrated system for intelligent analysis of regulatory regions of genes . In Silico Biology v.11 (2011/2012), IOS Press, pp. 97-108

  • Васькин Ю.Ю., Хомичева И.В., Игнатьева Е.В., Витяев Е.Е. Анализ последовательностей регуляторных районов генов реляционной системой ExpertDiscovery, встроенной в пакет UGENE . Вестник НГУ, серия: Информационные технологии, Т.10, вып. 1, Новосибирск, 2012, стр. 73-86

  • Irina Khomicheva, Evgenii Vityaev, Yurii Vaskin, and Timur Shipilov. Analysis and Prediction of Regulatory Regions of Eukaryotic Genes by integrated UGENE and ExpertDiscovery Systems. DMFGP '11, The 5th International Workshop on Data Mining in Functional Genomics and Proteomics: Current Trends and Future Directions (ECML-PKDD 2011 European Conference on Machine Learning and Principles and Practices of Knowledge Discovery in Databases), September 5, 2011, Athens, Greece, pp. 43-52.

  • Хомичева И. В., Витяев Е.Е., Игнатьева Е.В., Ананько А.Е., Шипилов Т.И. Применение программной системы ExpertDiscovery для поиска закономерностей структурно-функциональной организации регуляторных районов генов. Вестник НГУ, серия: Информационные технологии, Т. 8, вып. 1, Новосибирск, 2010, стр. 12-26, 2010

  • Khomicheva I.V., Vityaev E.E., Ananko E.A., Shipilov T.I., Levitsky V.G. ExpertDiscovery system application for the hierarchical analysis of eukaryotic transcription regulatory regions based on DNA codes of transcription. Intelligent Data Analysis, Special issue on "Machine learning and bioinformatics" eds. Nikolai Kolchanov, Evgenii Vityaev. v.12(5), IOS Press, 2008, pp. 481-494

  • Vityaev Е.E., Lapardin K.A., Khomicheva I.V., Proskura A.,L. Transcription factor binding site recognition by regularity matrices based on the natural classification method. Intelligent Data Analysis, Special issue on "Machine learning and bioinformatics" eds. Nikolai Kolchanov, Evgenii Vityaev. v.12(5), IOS Press, 2008, pp. 495-512

  • Шипилов Т.И., Хомичева И.В., Витяев Е.Е. Программная система ExpertDiscovery для анализа регуляторных районов ДНК. Информационные технологии работы со знаниями: обнаружение, поиск, управление (Вычислительные системы, вып. 175), Новосибирск, 2008, стр. 136-156

  • Khomicheva, A. Demin, E. Vityaev Transcription Factor Binding Site Discovery by the Probabilistic Rules. Proceedings of the 2nd workshop in data mining in functional genomics and proteomics. The 18th European conference on Machine Learning and the 11th European conference on Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases. Warsaw, Poland, September 17-21, 2007, p.104-109

  • E.E. Vityaev, T.I. Shipilov, M.A. Pozdnyakov, O.V. Vishnevsky, A.L., Proscura, Yu.L. Orlov, P. Arrigo Software for analysis of gene regulatory sequences by knowledge discovery methods. In: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (Eds. N.Kolchanov and R. Hofestaedt) Springer Science+Business Media, Inc. 2006, pp. 491-498. (preliminary version)

  • Nikolay A. Kolchanov, Mikhail A. Pozdnyakov, Yury L. Orlov, Oleg V. Vishnevsky, Nikolay L. Podkolodny, Eugenii E. Vityaev and Boris Kovalerchuk. Computer System "Gene Discovery" for Promoter Structure Analysis In: Artificial Intelligence and Heuristic Methods in Bioinformatics, Eds: P. Frasconi and R. Shamir, IOS Press, 2003, pp.173-192 (preliminary version)

  • Vityaev E.E., Orlov Yu.L., Pozdnyakov M.A., Vishnevsky O.V., Kolchanov N.A., Kovalerchuk B.K. Knowledge Discovery for Promoter Structure Analysis. In: Proceedings of the International Conference on Imaging Science, Systems, and Technology Eds.: Hamid R. Arabnia, Youngsong Mun, Las Vegas, Nevada, USA, June 24-27, 2002, CSREA Press, v.1, 122-128

  • Vityaev E.E., OrlovYu.L., Vishnevsky O.V., Kovalerchuk B.K., Belenok A.S., Podkolodnii N.L., Kolchanov N.A. Computer system "Gene Discovery" for functional annotation of DNA sequences. In: ECML'2001 Workshop Machine Learning as Philosophy of Science Ed. K.B. Korb, H. Bensusan, Freiburg, Sept., 2001. p.1-11.

  • Vityaev E.E. et al., Computer system "Gene Discovery" for promoter structure analysis, In Silico Biol. 2 (2002) 0024

  • Vityaev E.E., OrlovYu.L., Pozdnyakov M.A., Levitsky V.G., Vishnevsky O.V., Podkolodnii N.L., Kolchanov N.A. Computer system "Gene Discovery" for regularities retrieving and knowledge representation in integrated electronic library "GeneExpress" on gene expression regulation. (RCDL'2002 - Forth All Russia conference "Electronic libraries: perspective methods and technologies, electronic collections", Dubna, 15-17 oct. 2002), 6p (in Russian). http://rcdl2002.jinr.ru/login_r.htm.

  • Vityaev E.E., Orlov Yu.L., Vishnevsky O.V., Belenok A.S., Kolchanov N.A. Computer System "Gene Discovery" to Search for Patterns in Eukaryotic Regulatory Nucleotide Sequences, Molecular Biology, Vol. 35, No. 6, 2001, pp. 810-817

  • Vityaev E.E., Vishnevsky O.V. Analysis and Recognition of Erythroid-Specific Gene Promoters basing on trancated Oligonucleotide Motifs, J. Mol. Biology, 2001, 35:6 (in Russian).

  • Pozdnyakov M.A., Vityaev E.E., Anan'ko Е.А., Ignat'eva Е.V., Podkolodnaya O.A., Podkolodnii N.L., Lavryshev S.V., Kolchanov N.A., Comparative Analysis of Methods Recognizing Potential Transcription Factor Binding Sites, Molecular Biology, Vol. 35, No. 6, 2001, pp. 818-825.